ВВМУ “Никола Йонков Вапцаров” е акредитирано за обучение и обучава докторанти по следните научни специалности:
- Корабни силови уредби, машини и механизми
- Електротехнологии
- Електроснабдяване и електрообзавеждане по отрасли ( електроснабдяване и електрообзавеждане на кораба)
- Радиолокация и радионавигация
- Комуникационни мрежи и системи
- Управление на кораби и корабоводене
- Експлоатация на водния транспорт, морските и речните пристанища
- Военна психология
- Организация и управление на въоръжените сили
